Du vælger den mappe, du gerne vil søge i, indtaster de kriterier, der skal være opfyldt, og vælger hvilket felt i beskeden, der skal opfylde kriteriet. Når du klikker på "Søg"-knappen og sender din søgning afsted vil der komme en liste frem med de beskeder, der opfylder din søgning. Du kan i denne liste vælge en besked du gerne vil læse og læse den som normalt.

Bemærk, at når du normalt læser beskeder og så vælger funktionen "Søg" så vil den mappe, du netop nu læser beskeder fra, være den mappe, der som standard er valgt til søgningen. Hvis du for eksempel sad og så på oversigten over mappen "Venner" og så klikker "Søg", så vil "Venner" allerede være valgt som den mappe, der skal søges i.

Til venstre for indtastningsfeltet vil du se en liste over, hvilke felter du kan søge i. Denne liste indeholder: Besked, Overalt, Emne, Fra, CC, Til.

Besked - Søger gennem selve indholdet af en besked. Dette er den del af en besked, hvor alt det vigtige normalt står.

Overalt - Denne mulighed søger over alt også i alle headerne for en besked. Med mindre du er helt sikker på, at det er dette du gerne vil, så er det det nok ikke. Denne mulighed kan returnere noget uventede resultater.

Emne - Søger gennem emnelinien for beskederne.

Fra - Hvem beskeden er fra. Bemærk at dette kan være mere end det, du umiddelbart kan se i oversigten. Normalt indeholder et "Fra"-felt både navn og e-mail adresse, men SquirrelMail viser normalt kun navnet. Hvis dit kriterie for søgningen opfyldes af e-mail adressen vil beskeden stadig blive returneret som resultat selv om e-mail adressen ikke vises.

Til - Hvem beskeden blev sendt til. Dette kan være flere personer og ikke nødvendigvis kun en enkelt e-mail adresse.

Cc - Det samme som "Til" men søger i stedet i dem, der stod i feltet "Kopi til".