CRM-20640: contribution summary report: duplicates values with group filter

Merge pull request #10593 from civicrm/4.7.21-rc

4.7.21 rc

Merge pull request #10583 from seamuslee001/CRM-20789

CRM-20789 Fix unsubscribing when link comes from an AB Test

Merge pull request #10579 from eileenmcnaughton/deprecated2

CRM-20786 Move deprecated utils functions to the import classes

Merge pull request #10591 from totten/master-casetype-flush

CRM-20802 - CaseType - Flush any in-memory caches that might reference case-type

CRM-20802 - CaseType - Flush any in-memory caches that might reference case-type

Fix bug in open case status selector

Merge branch '4.7.21-rc' into master

Merge pull request #10575 from JMAConsulting/CRM-20747-rc

CRM-20747: {contribution.campaign} token not working on Contribution

Merge pull request #10533 from JMAConsulting/CRM-20747

CRM-20747: {contribution.campaign} token not working on Contribution ThankYou letter

Merge pull request #10574 from eileenmcnaughton/cms

CRM-20780 Add drupal option to define CMS_ROOT

Merge pull request #6 from totten/eileenmcnaughton-cms

CRM-20780 - System::cmsRootPath() - Use the same override on all CMS's

CRM-20780 - System::cmsRootPath() - Use the same override on all CMS's

CRM-20780 Add drupal option to define CMS_ROOT

CRM-20789 Add check based on mailing_type following chat with Tim to ensure only deailing with AB tests

Merge pull request #10527 from eileenmcnaughton/act

Replace a couple of calls to deprecated function

Merge pull request #10581 from eileenmcnaughton/deprecated4

CRM-20786 consolidate calls to deprecated function

CRM-20789 Fix unsubscribing when link comes from an AB Test

CRM-20789 Fix retrieving entity when in AB test context

CRM-20786 consolidate calls to deprecated function

Merge pull request #10577 from totten/4.7.21-rc-src

CRM-19303 - Drupal - Restore getCiviSourceStorage()

CRM-20786 copy deprecated utils function 'inids' to import class.

Will work separately to fully remove it

CRM-20786 Move deprecated utils functions to the import classes

Merge pull request #10576 from JMAConsulting/CRM-20781

CRM-20781: Truncate long text in mail listing

CRM-20786 combine functions in order to move to class

Merge pull request #10558 from JMAConsulting/CRM-20412

CRM-20412: mailing report: unique opens detail view inaccurate

CRM-20781: Truncate long text in mail listing

CRM-19303 - Drupal - Restore getCiviSourceStorage()

This partially reverts changes made under CRM-19303:
 * The changes to `getDefaultFileStorage()` are preserved
 * The changes to `getCiviSourceStorage()` are reverted
 * To avoid conflicts, `parseDrupalSiteName()` has been split into the older `parseDrupalSiteNameFromRoot()` and the newer `parseDrupalSiteNameFromRequest()`.
   (IMHO, `parseDrupalSiteNameFromRequest()` is more correct, but `parseDrupalSiteNameFromRoot()` is more compatible with existing deployments).

As discussed in [PR #10513](https://github.com/civicrm/civicrm-core/pull/10513#issuecomment-310506829),
we should stop trying so hard to autodetect these things.  We'll treat the
auto-detection stuff as legacy, and should shift toward a simpler/flatter arrangement
which encourages paths/URLs to be stored in `civicrm.settings.php`.

Merge pull request #10571 from totten/master-joomla-hook

CRM-19914 - CRM_Utils_Hook - Fix `civicrmHooks.php` on Joomla

Merge pull request #10573 from totten/master-nav-hash

CRM-20776 - Navigation - Fix menu items with mix of #, ?, &

CRM-20747: {contribution.campaign} token not working on Contribution

CRM-20747: {contribution.campaign} token not working on Contribution ThankYou letter

Merge pull request #10572 from seamuslee001/CRM-20774-words

CRM-20774 Add in additional words on contacting system administrator …

CRM-20774 Add in additional words on contacting system administrator for assistance

CRM-20776 - Navigation - Fix menu items with mix of #, ?, &

== Use case

 * Use an extension to implement `hook_civicrm_navigationMenu`.
 * Add or edit the URL of a menu item to use a mix of URL control chars -- eg `civicrm/case/a/#/case?dtab=0&dme=0`
 * Look in the CiviCRM navigation bar and see the final URL of the link.

== Before

 * The URL is munged (eg `http://dcase.l/civicrm/case/a/?dtab=0&dme=0#/case`)

== After

 * The URL appears consistent (eg `http://dcase.l/civicrm/case/a/#/case?dtab=0&dme=0`)

== Testing

 * On Drupal 7, I activated all components (CiviContribute, CiviMail, etal) to build a large pool of menu items.
   Then I grabbed the menu content (eg `http://dcase.l/civicrm/ajax/menujs/202/en_US/1/abcd1234`) -- both with and
   without the patch. The content was the same, except for the intended items.
 * Repeated above on WordPress (which does not use clean URLs).

Merge pull request #10566 from jitendrapurohit/indexfix

CRM-20774 - Add check for existing key index in table

CRM-19914 - CRM_Utils_Hook - Fix `civicrmHooks.php` on Joomla

Merge pull request #10552 from colemanw/CRM-19778

CRM-19778 - Api.getoptions - Filter status id by case type id

Merge pull request #10569 from eileenmcnaughton/perm

CRM-20778 - Use civicontribute permission for contribution recur.cancel

Merge pull request #10570 from civicrm/4.7.21-rc

Update `master` with latest `4.7.21-rc`

Merge pull request #10567 from totten/4.7.21-rc-rm

CRM-20243 - Actively remove old files

CRM-20778 - Use civicontribute permission for contribution recur.cancel

CRM-20243 - CRM_Utils_Check - Simplify Auth/SASL checks

Mark failing test incomplete

CRM-19778 - Api.getoptions - Filter status id by case type id

add test

Merge pull request #10568 from francescbassas/patch-10

CRM-20775 Wrong is full results for API event get

Code style

CRM-20775 Wrong is full results for API event get

CRM-20243 - CRM_Upgrade_Form - Delete orphaned files before upgrade

CRM-20243 - Add check for deleted files

CRM-20243 - Civi\Core\Paths - Define 'civicrm.packages' variable (etal)

In the long run, the file location of the `packages`, `vendor`, and
`bower_components` should be adjustable (depending on how the codebase is
built).

This patch begins loosening the coupling between the `$civicrm_root` and
those folders.

existing test fixes

Add check for existing key index in table

Merge pull request #10554 from eileenmcnaughton/crazy_vars

[NFC] Cleanup towards CRM-20759, define variables more legibly & consistently.

Merge pull request #9886 from JMAConsulting/CRM-20169

CRM-20169 WIP (possibly wanting refactor of whole report) Added alterReportVar hook support to activity report

Merge pull request #10452 from JMAConsulting/CRM-20668

CRM-20668, Fixed Notice error

Merge pull request #10346 from JMAConsulting/CRM-20567

CRM-20567: backoffice membership via price set errors with non-aggregated column

Merge pull request #10497 from JMAConsulting/CRM-20721

CRM-20721: Add parameter to dateQueryBuilder fn to change date value to desired format

Merge pull request #10562 from JMAConsulting/CRM-20411

CRM-20411: mailing tab listing: MySQL 5.7 group by error

Fix bug in open case status selector

Merge pull request #10507 from lcdservices/CRM-20739

CRM-20739 process groups for import using fill

Merge pull request #10561 from seamuslee001/CRM-20771

CRM-20771 Ensure that addColumn can handle translatable columns

CRM-20411: mailing tab listing: MySQL 5.7 group by error

CRM-20412: mailing report: unique opens detail view inaccurate

CRM-20771 Ensure that addColumn can handle translatable columns

Cleanup towards CRM-20759, define variables more legibly & consistently.

I really want the 2 copy & paste variants of this code loop to be combinable but I think it takes a numebr
of small changes to get there in a readable way

Merge pull request #10492 from seamuslee001/CRM-20716

CRM-20716 Fix Array to string error because subject is an array not string

Merge pull request #10550 from yashodha/CRM-20765

CRM-20765 - Missing id for 'onBehalfOfOrg' section

Merge pull request #10560 from civicrm/4.7.21-rc

4.7.21 rc

Merge pull request #10555 from totten/4.7.21-install-port

CRM-20768 - Installer UI - Accept mysql port

Merge pull request #10559 from civicrm/4.7.21-rc

4.7.21 rc

Merge pull request #10556 from devarun/4.7.21-rc

CRM-20644: Column names on Advanced search results displayed on contacts are out of order.

Merge pull request #10536 from yashodha/CRM-20753

CRM-20753 - Net amount doesn't respect localization

CRM-20644: Column names on Advanced search results displayed on contacts are out of order.

CRM-20768 - install - Improve docblock

CRM-20768 - Install UI - Distinguish host/port in IPv6

CRM-20768 - install - Accept mysql port

== Background ==

In previous releases, the web-based installation script allowed you to enter
the MySQL "server" with a `host:port` combination (e.g.  `127.0.0.1:3307`).

I believe this regressed during the mysql=>mysqli transition.

== Before ==

If you use the web-based install UI and enter a `host:port` combination, the
error messages indicate a confusing mix of information (e.g.  some
indicating port 3306, some indicating port 3307).

== After ==

If you use the web-based install UI and enter a `host:port` combination, it
uses the specified port.

----------------------------------------
* CRM-20768: Web-based installation should accept non-standard MySQL port
  https://issues.civicrm.org/jira/browse/CRM-20768

Merge pull request #10545 from totten/master-ui-bootstrap

CRM-20756 - Add Angular `ui.bootstrap` library

added unit test

CRM-20567: backoffice membership via price set errors with non-aggregated column

Merge pull request #10541 from JMAConsulting/CRM-20411

CRM-20411: mailing tab listing: MySQL 5.7 group by error

Merge pull request #10498 from JMAConsulting/CRM-20722

CRM-20722: 'Lock wait timeout exceeded' error triggered on smart group cache rebuild

Merge pull request #10407 from JMAConsulting/CRM-19653

CRM-19653: Custom field checkboxes migrated incorrectly on merge (part deux)

Merge pull request #10298 from colemanw/CRM-20387

CRM-20387 - Add invoice_number field for human readable contribution invoice

Merge pull request #10549 from jitendrapurohit/CRM-20761

CRM-20761 : Formrule error when priceset is selected on contribution page

CRM-20387 - Add invoice_number field for human readable contribution invoice

CRM-20765 - Missing id for 'onBehalfOfOrg' section

Merge pull request #10547 from eileenmcnaughton/extract

[NFC] Extract submit in mapFields to start adding unit testing (towards CRM-20759)

Extract submit in mapFields to start adding unit testin (CRM-20759)

Merge pull request #10544 from eileenmcnaughton/deprecated

CRM-20758 remove call to deprecated function & add test

CRM-20761: Formrule error when priceset is selected on contribution page

CRM-20758 remove one more deprecated call

Merge pull request #10542 from seamuslee001/CRM-20720

CRM-20720 CRM-20757 Fix issue where Price Options were not being sort…

CRM-20756 - Add Angular `ui.bootstrap` library

This adds the library
[ui.bootstrap](https://angular-ui.github.io/bootstrap/), which makes it
easier to include the functional elements of Bootstrap in AngularJS pages.

In the past, adding this was problematic, but now the situation has
improved:

1.  civicrm-core has upgraded to AngularJS 1.5.  (In the past, civicrm-core
used AngularJS 1.3, which was incompatible.)

2.  civicrm-core allows optional AngularJS modules.  (In the past, all
modules were loaded unconditionally, which could result in loading
new/unnecessary code for legacy users.  Now, you can opt-out of this
behavior with `basePages=>array()`.)

Merge pull request #10274 from eileenmcnaughton/activity2

CRM-19821 performance improvement on the activity search

CRM-19821 turn action links into relative links.

This is to fix the test in the first instance but discussed with Seamus & Monish & both
felt that relative links are more correct

CRM-19821 unit test

CRM-19821 performance improvement on the activity search.

This commit removes 2 bad joins from the activity search
- priority_id - this is just removed from the returnProperties as it is not rendered
- activity_status_id - this is handled as a pseudoconstant rather than the bad join

activity_type_id is partially handled, however, there is a component_id filter
that needs to be fixed before the bad join on this
field can be removed.

CRM-20758 remove call to deprecated function & add test

CRM-20720 CRM-20757 Fix issue where Price Options were not being sorted by weight